O reflorestamento da Ilha Brasileira envolveu diversas universidades do Brasil, Uruguai e Argentina, instituições governamentais e ONGs dedicadas ao plantio e manutenção de vegetação em áreas que tenham sido degradadas ou destruídas. O reflorestamento da vegetação nativa da Ilha teve como objetivo a restauração ecológica, ou seja, uma intervenção por meio do plantio para recompor o ecossistema destruído pelo incêndio de 2009.
Para o plantio, foram escolhidas as espécies de acordo com a vegetação natural da Ilha Brasileira: árvores frutíferas e com floração atraente para animais a fim de realizar a dispersão de sementes.
| Psidium cattleyanum Araça | Annona sylvatica Araticum |
| Schinus terebinthifolius Aroeira Vermelha | Garcinia gardneriana Bacupari |
| Butia sp Butiá | Myrciaria tenella Cambuí |
| Eugenia involucrata Cerejeira Silvestre | Casearia sylvestris Chá de Bugre |
| Allophilus edulis Chal-Chal | Acca sellowiana Goiaba Serrana |
| Eugenia brasiliensis Grumixama | Myrcianthes pungens Guabiju |
| Campomanesia xanthocarpa Guabirova | Inga vera Ingá Banana |
| Plinia peruviana Jaboticaba | Syagrus romanzoffiana Jerivá |
| Vasconcellea quercifolia Mamoeiro do Mato | Ruprechtia laxiflora Marmeleiro do Mato |
| Eugenia myrcianthes Pêssego do Mato | Eugenia uniflora Pitanga |
| Campomanesia guazumifolia Sete Capotes | Celtis ehrenbergiana Taleira |
| Vitex megapotamica Tarumã | Phytolacca dioica Umbu |
| Eugenia pyriformis Uvaia |
